Герои, известные нам по первой части фильма, отдыхают на уютном пляже. Вдруг Луффи замечает, что их корабль удаляется от береговой линии. Теперь друзьям приходится немедленно отправиться на поиски корабля, украденного пиратами.

Сюжет вращается вокруг молодого пилота Хикару Ичидзё, его возлюбленной из Макросс-сериала Мисы Хаясе и начинающей певицы Линн Минмэй. Эта история происходит на фоне беспощадной войны между людьми и Зентради (великанами-мужчинами), обладающими космическим флотом из миллионов кораблей. Зентради и Мельтанди (великаны-женщины) живут отдельно друг от друга и являются врагами друг другу. В ходе войны уничтожается практически всё живое на планете Земля со всеми её жителями. В живых остаются исключительно экипаж Макросса и его жители. Во время этой войны Миса Хаясе и Хаикару Ичидзё оказываются на выжженой войной Земле, где находят город-крепость «Протокультуры» и подают сигнал Макроссу.

Сюжетная линия японских анимационных фильмов по мотивам древнегреческой мифологии продолжается! Действие происходит после боя против Аида, в котором Сейя был ранен. Он находится под опекой Саори до тех пор, пока не появляются несколько вражеских ангелов во главе с Артемидой.

Это продолжение первого сезона сериала о девушке, по имени Энжи, ставшей Звездой надежды. После битвы с Духом Сэкриа, Коридор измерений оказывается разрушенным, а Энжи запертой во вселенной Сэйдзю. Королева Вселенной таинственным образом исчезает, а баланс Сэкриа вот-вот нарушится. Для спасения вселенной необходимо найти девять Хранителей и спасти королеву. Справится ли Энжи со столь сложным заданием? Сможет ли она вернуться во вселенную Синтё к своим друзьям?