Продолжение приключений Кеншина Химуры, который, став бродягой после революции, находит приют в додзё кендо Каору Камии. На этот раз ему предстоит сразиться с воплощением зла Шишио Макото, который во время войны пошёл по стопам Кеншина, став наёмным убийцей, но только ему это приносило невыразимое удовольствие. И вот спустя несколько лет Шишио решает собрать армию таких же безумных убийц, чтобы свергнуть правительство Мэйдзи, которое в конце революции, посчитав его слишком опасным, попыталось его убить. Кеншин, чувствуя за это некоторую ответственность и понимая, что он не может закрыть глаза на преступления Шишио, снова отправляется в путь, чтобы остановить злодея.

Чтобы свергнуть ненавистное правительство Мейдзи и ввергнуть Японию в хаос, Шишио Макото направляет свой броненосец к берегам Токио. Кеншин Химура, понимая, что он недостаточно силён, направляется к своему учителю, чтобы познать предельную технику и окончить обучение, которое он не завершил, приняв когда-то решение уйти сражаться на гражданскую войну. Мастер настроен скептически, он не уверен, что у его никудышного ученика хватит сил справиться с Шишио Макото, который ни перед чем не остановится. Сможет ли Кеншин остановить Шишио, не нарушив своей клятвы не отнимать жизнь?