Гражданская война, названная Реставрацией Мэйдзи, окончилась. В Японии полным ходом идут реформы по западному образцу. Нет больше сёгуната, созданы парламент и правительство, самураи примеряют европейские костюмы, крестьяне получают фамилии, расцветают торговля и предпринимательство. Вот только почему герой тайной войны времен Бакумацу неузнанным бродит по стране в обличии добродушного простака, помогая всем, кто в беде, и ничего не прося взамен? Так Химура Кэнсин, великий мастер меча и бывший убийца поневоле, пытается искупить грехи прошлого и найти мир в израненной душе.Краткая передышка застает Кэнсина в Токио — бывшем Эдо, где он спасает Каору Камия, молодую хозяйку семейного додзё. Постепенно в додзё Камия собирается теплая компания бродяг и неудачников — Каору, Кэнсин, наемный боец Саносукэ и сирота Яхико. Вот только спокойная жизнь, наполненная веселыми похождениями и шутливыми перепалками, продлилась недолго. Ведь прошлое никуда не ушло, и слишком многие считают, что кровь можно смыть только куда большей кровью…

Во время Гражданской войны Химура Кеншин, добровольно поступив на службу, стал тайным палачом, убивая самых влиятельных лидеров оппозиции. Но время битвы окончилось, и он, решив, что больше не возьмёт в руки катану отправляется путешествовать по стране, чтобы помогать слабым и беззащитным, так как их по-прежнему притесняют. В Токио Кеншин помогает девушке Каору, которая преподаёт кендо, спасти своё додзё от бандитов. Раскрыв преступникам свою настоящую личность, он заставляет удариться их главаря в бега. Решив, что на этом его дело закончено, герой решает продолжить свой путь, но Каору предлагает ему остаться и помочь восстановить разрушенное после битвы додзё. Но недолго Кеншин наслаждается спокойной жизнью, ведь прошлое следует за ним по пятам…