В основе сценария «Гадких лебедей» — повесть о городе-призраке с интернатом для одаренных детей. Там подрастает племя молодое и пугающе странное, чьими учителями являются существа «мокрецы» — то ли мутанты, то ли пришельцы. В городе происходит беспричинное изменение климата, напоминающее вселенский потоп. Естественно, вокруг вьются бесчисленные комиссии, изучающие эту аномалию, спецслужбы и спецагенты.Герой фильма, писатель Виктор Банев вынужден вести собственное расследование этой ситуации, так как среди детей интерната находится его дочь. По сути, он включается в борьбу не только за судьбу конкретных детей и своей дочери, но и за ту форму Будущего, которое выберет человечество.

Для молодой Ксении жить по законам условной среды обитания становится нормой. Для девушки самым ярким событием становится её красная сумка «Биркин», которую ей подарил её молодой человек. Однако всё меняется в тот момент, когда она остаётся наедине с голосом, который мерно начитывает ей в наушники новеллу Ивана Бунина «Смарагд». Воображая, что она и её парень — персонажи из начала ХХ века, Ксения встаёт перед выбором. Однако какой она даст ответ на заветный вопрос?