Противостояние между США и Китаем заканчивается ядерной войной, опустошившей северное полушарие. Смертоносное облако дрейфует к южному полушарию, убивая всё на своём пути. Экипаж американской подводной лодки находит убежище в Австралии, которую ещё не накрыли радиоактивные осадки.

Томас Андерсон всегда жил двойной жизнью. Днём он был обычным программистом, а по ночам - известным хакером Нео. Нео всегда задавался вопросом: что реально в этом мире, однако истину он даже представить себе не мог. Однажды он знакомится с Морфиусом - великим хакером и террористом в глазах правительства. Морфиус рассказывает Нео, что всё, что он знал в жизни - это лишь иллюзия, а мир - это искусственно созданная Матрица, и показывает ему настоящую реальность.