События фильма разворачиваются на осколках человеческой цивилизации, когда все Автоботы и Дисептиконы уже покинули нашу планету. Группа учёных при поддержке влиятельных бизнесменов старается вывести земные технологии на новый уровень, извлекая урок из предыдущего нападения на планету. Но в это же время древние могущественные силы видят Землю своей следующей мишенью.