У неугомонной девочки, живущей совместно с лошадью Альфонсо и обезьянкой Мистером Нельсоном, появляются враги. Это — бизнесмены, желающие отобрать землю и дом Пеппи, а также работники детского приюта, которые стремятся лишить её независимости.

Тёмный маг Геллерт Грин-де-Вальд, сбежавший из-под стражи Магического Конгресса Соединённых Штатов, переманивает на свою сторону чистокровных волшебников, чтобы взять под контроль всех магических животных, тем самым заполучив безграничную власть над миром волшебников. Стремясь сорвать хитрые планы Грин-де-Вальда, Альбус Дамблдор просит помощи у Ньюта Саламандера, и тот соглашается, не зная какая опасность их ждёт впереди.