Специальные агенты ФБР, Фокс Малдер и Дана Скалли, снова работают вместе, чтобы расследовать странные и необъяснимые дела связанные с паранормальными явлениями.

Семья Соломон переезжает из Чикаго в Северную Дакоту, на ферму, окружённую полями подсолнухов. Однако вскоре после приезда шестнадцатилетняя Джесс и её маленький брат Бен начинают замечать непрошенных гостей. Призраки тех, кто когда-то жил в доме, начинают вмешиваться в жизнь живых с весьма недобрыми намерениями. Для Джесс же кошмар начинается в тот момент, когда она понимает, что никто в доме не верит ей и во всех происшествиях винят только её.

В архивах ФБР накопилось много нераспутаных дел, связанных с мистикой и паранормальными явлениями. ФБР запускает проект "Секретные материалы" и поручает работу над ним специальным агентам Фоксу Малдеру и Дане Скалли. Малдер верит в существование внеземного разума и потустороннего мира, а Скалли, являясь доктором Академии ФБР, пытается все загадочные события загнать в рамки науки. Однако, чаще всего, ей это не удается. Официальная наука не в силах объяснить причины и взаимосвязи событий, расследованием которых им приходится заниматься.