Мотоко Кусанаги, Бато и другие сотрудники 9-го отдела начинают охоту на танк, который самовольно покинул военный полигон, а также проводят расследование серию загадочных самоубийств андроидов старых моделей. После смерти друга Тогусы агенты нападают на след таинственного хакера, известного под именем Смеющийся Человек.

Девочка Тихиро и её семья по пути к новому загородному дому попадают в дорожное происшествие. Выйдя из машины, они обнаруживают неподалёку ресторан с соблазнительными яствами, но подозрительно то, что в нём нет обслуживающего персонала. Все принимаются за трапезу, кроме девочки, которая чувствует опасность. Подозрения Тихиро оказываются правдой: её родители превращаются в свиней, и она узнаёт, что это место кишит призраками.

Главный герой по прозвищу JD зарабатывает себе на жизнь, принимая участие в подпольном боксёрском клубе. Но его мечта — участие в самом широкомасштабном турнире «Мегалония», где соберутся все самые талантливые боксёры, чтобы сразиться за титул «сильнейшего». И судьба, которая сжалилась над молодым мечтателем, предоставляет герою такой шанс.