1987 год. Уходя от преследователей, Бамблби прячется на автосвалке в одном из калифорнийских городков, принимая облик Фольксвагена Жука. В этом же городе живёт 17-летняя Чарли, которая жаждет найти своё призвание в жизни. В один из дней она находит Бамблби и понимает, что перед ней не просто обычный автомобиль...

Кубо происходит из великого рода, однако в момент, когда жаждущие мести духи прошлого решили вернуться, то на защиту отважились встать лишь двое хранителей. Теперь, чтобы получить хотя бы единственный шанс на спасение, герою предстоит найти доспехи своего отца, величашего и легендарного самурая.