Действие анимационного фильма происходит в будущем. На Землю обрушивается катастрофа в виде монстров. Но человечество не намерено просто так сдаваться. Были изобретены специальные высокотехнологичные роботы Франксы, которыми должны управлять два пилота: девочка и мальчик. Главный герой Хиро, кодовое имя «016», рос, как и все дети, только с одной целью: стать пилотом и вступить в бой с монстрами. Он всегда считался одарённым учеником, но неожиданно он вместе со своей напарницей проваливает последний экзамен. Если Хиро не может управлять Франксом, то его жизнь окончена, жить больше незачем. Но снова к жизни его возвращает странная девушка по имени Зэро Ту, по прозвищу «убийца напарников», которую опасаются остальные пилоты по понятным причинам. И первое, что она говорит Хиро при встрече: «Я нашла тебя, мой милый».

Родители главного героя Ю Наруками уезжают работать заграницу и ему приходиться на время переехать из шумного мегаполиса в тихий маленький городок к своему дяде. 17-летний парень страдает от скуки, его не устраивает новая школа, класс, учителя, ему неприятен неторопливый ритм здешней жизни. Но неожиданно этот уютный городок сотрясает серия жестоких убийств. Ю и его новые друзья решают выяснить, кто стоит за всеми этими злодеяниями.