Вернувшись на Землю, команда корабля «Энтерпрайз» понимает, что их организация подорвана изнутри. Флот скован ужасом и бездействует, пока мир всё глубже погружается в бездну. Капитан Кирк возглавляет операцию по поимке злодея, способного уничтожить всё человечество. Любовь и дружба будут принесены Кирком в жертву ради его команды...

В день рождения Джеймса Кирка его отец погибает в последней битве против загадочного отряда пришельцев. Он искал командора Спока, который в тот момент был ещё ребёнком и жил на планете Вулкан, презираемый соседями за свою получеловеческую природу. Двадцать лет спустя Кирк стал молодым бунтарём, пытающимся проявить себя на корабле Старфлит, несмотря на напряжённые отношения со своим наставником командором Споком. Неожиданно на Вулкане происходит катастрофа, и легендарный военный корабль "Энтерпрайз" набрал команду молодых кадетов для отправки на пострадавшую планету. Кирк вошёл в число избранных...

Корабль «Энтерпрайз» обнаруживают необычный прототип андроида, созданного доктором Сунгом. Однако времени на его изучение у экипажа нет, так как их срочно вызывают на Ромул. Здесь в результате государственного переворота к власти пришёл страшный лидер, у которого есть оружие, способное уничтожить всё живое на планете Земля - главной планете Федерации.

Спустя 15 лет после того, как сверхчеловека Хана отправили на необитаемую планету за его преступления, он возвращается в цивилизацию, чтобы отомстить адмиралу Кирку. Появление давнего врага удручающе подействовало на адмирала, который упивался своим кризисом среднего возраста. Поэтому, чтобы победить Хана, Кирку придётся сначала победить себя.