Сила Нео растёт. Теперь он может использовать её не только в Матрице, но и в реальном мире, а также может отделять сознание от тела. В результате этих экспериментов он застревает на станции между мирами. Тем временем Зион готовится к решающему сражению с машинами. Их шансы на победу минимальны, поэтому все ждут Нео - избранного, способного спасти людей. Однако никто неподозревает, что в войне участвует третья сторона, чья цель уничтожить оба мира.

Джерри Шоу - молодой разгильдяй, который не задумывается о своём будущем. Но однажды жизнь кардинально меняется: его брата-учёного убивают, а самого Джерри вместе с незнакомой женщиной выставляют террористами. Как выпутаться из такой передряги, когда каждое движение отслеживается с помощью технологий и камер по всему миру?

Прошло полгода после того, как Нео впервые попал в реальный мир. Все больше и больше людей освобождаются от Матрицы и прибывают в Зион - последний свободный город людей. Нео открывает в себе сверхспособности, способные помочь ему в войне с машинами. Неожиданно жители Зиона узнают, что 250 000 машин делают подкоп под городом и ворвутся в него в течение 72 часов. Зион готовится к войне, а Нео, Морфиус и Тринити отправляются на поиски Ключника...

Война в Персидском заливе. Прошедший спецподготовку потомственный военный Энтони Суоффорд был отправлен на Ближний Восток. Здесь ему придётся столкнуться не только с невыносимой жарой и бесконечной пустыней, но и с невидимым врагом, хорошо ориентирующимся в данной местности. Энтони и его однополчане вынуждены умирать, не зная за что они борются.

Барни Росс глава "Неудержимых" - команды высококвалифицированных наёмников. Таинственный заказчик поручает им убить диктатора в маленькой стране на юге Африки. Выполнившие многие невероятно трудные задания, казалось "Неудержимые" готовы ко всему, однако это не так. В Африке с помощью местной бунтарки Сандры они узнают истинную причину конфликта и их миссии. В определённый момент Россу придётся принять решение: спасти свою жизнь или пожертвовать собой, чтобы спасти Сандру.

Действие происходит во время войны во Вьетнаме. Отряд 25-й пехотной дивизии разделился на две части: во главе с сержантами Робертом Барнсом и Элайасом Гродином. Отряды по-разному реагируют и приспосабливаются ко всем ужасам войны, порой деградация приводит к тому, что солдаты вынуждены предавать своих братьев по оружию...

Смертельная угроза грозит Вселенной: гигантские разумные жуки готовы уничтожить всё живое. С Земли был отправлен элитный звёздный десант на борьбу с насекомыми. От них зависит будущее родной планеты.