Сила Нео растёт. Теперь он может использовать её не только в Матрице, но и в реальном мире, а также может отделять сознание от тела. В результате этих экспериментов он застревает на станции между мирами. Тем временем Зион готовится к решающему сражению с машинами. Их шансы на победу минимальны, поэтому все ждут Нео - избранного, способного спасти людей. Однако никто неподозревает, что в войне участвует третья сторона, чья цель уничтожить оба мира.

Республика начинает гибнуть под мощными ударами мощной Империи. Джедаем всё труднее удержать контроль над галактикой. В это время беременная Падме понимает, что Энакен переходит на тёмную сторону, и обратно дороги для него уже нет.

Прошло полгода после того, как Нео впервые попал в реальный мир. Все больше и больше людей освобождаются от Матрицы и прибывают в Зион - последний свободный город людей. Нео открывает в себе сверхспособности, способные помочь ему в войне с машинами. Неожиданно жители Зиона узнают, что 250 000 машин делают подкоп под городом и ворвутся в него в течение 72 часов. Зион готовится к войне, а Нео, Морфиус и Тринити отправляются на поиски Ключника...

Виктория осталась без отца ещё в младенчестве, а в 11 лет поняла, что её место - это трон Британской империи. Викторианская эпоха стала расцветом для всей империи, а сама Виктория правила более 63 лет. Однако никто на самом деле не знал, что составляло счастье самой королевы.

Республика начинает гибнуть под мощными ударами несокрушимой Империи. Джедаем всё труднее удержать контроль над галактикой. В это время беременная Падме понимает, что Энакен переходит на тёмную сторону, и обратно дороги для него уже нет.