Вооруженный бейсбольной битой ученик начальной школы совершает серию нападений на людей. По его следам идут двое детективов, которые вскоре понимают: это дело не похоже ни на какое другое из числа тех, что встречались им раньше…

Очередная серия о необыкновенном интеллекте детектива-старшеклассника Кудо Шиничи, используя который он раскрыл множество преступлений. В Токио строится два небоскрёба, Конан вместе с друзьями отправляется на экскурсию по новым зданиям. Спустя несколько дней архитектор башен найден убитым в своей квартире. Подозреваемым оказывается давний противник Конана – главарь Чёрной Организации.

На Земле остаётся только два государства, которые находятся на грани войны. Но когда на планету вторгаются пришельцы – безжалостные роботы, уничтожающие всё на своём пути, – им приходится объединиться. Чтобы победить незваных гостей, которых не берёт ничего, лучшие учёные Земли создают чудо-оружие. Этим новейшим изобретением могут управлять только молодые девушки, обладающие магией. Эти хрупкие девушки – последняя надежда человечества.