Задолго до начала времен, когда Солнечная система была лишь облаком межзвездной пыли среди ледяного безмолвия хаоса, Великий Генма, чудовищное воплощение вселенского зла, вел яростную битву против всего сущего, поклявшись превратить космос в мертвое Ничто. Миллиарды лет, порабощая тела невинных и подчиняя себе стихии, бесформенный ужас пожирал галактики и созвездия, и теперь на его пути стоит хрупкая и одинокая планета Земля, чья единственная надежда — горстка загадочных сверхлюдей.Эти бесстрашные и мудрые воины способны одним усилием воли воздействовать на предметы с сокрушительной силой, и скоро их ряды пополнят новички, еще не подозревающие о своих способностях — прекрасная и грозная трансильванская принцесса Луна и простой японский школьник Джо. Когда Нью-Йорк будет лежать в руинах, а Токио превратится в песчаную пустыню, они, познав всё могущество своих удивительных сил, вместе с древним боевым роботом Вегой и собратьями воинами выйдут на решающую битву с Великим Генмой.

Студента Такеши Хонго похитила террористическая организация под названием «Шокер», лидеры которой добиваются мирового господства. Все, кто попал в руки террористов, подвергаются болезненной реконструктивной хирургии, превращающей людей в киборгов, утративших человеческие эмоции и память. Тем не менее, Такеши удаётся вырваться из-под контроля и начать мстить.

Успешно скрывшись от всесильной террористической организации «Шокер», Такеши Хонго пытается адаптироваться к нормальной жизни. Он начинает работать учителем естествознания. Спокойный характер Хонго делает его объектом насмешек озорных школьников, но он обращает внимание только на одну проблемную ученицу, мятежную и своенравную Кикуму Котоми. Девушка с детства дружит с поп-идолом современности Чихару, чей дебютный альбом вызвал много шумихи. Тем временем, по Азии катится волна странных смертей, которые вызваны тем, что погибшие слушали гипнотические песни, исполняемые Чихару.

В одно мгновение жизнь Хаято рушится, когда гигантский робот Голем, круша Токио, убивает его родителей. Все уверены, что разрушитель был послан таинственным капитаном с Корабля-Призрака, который бороздит океан и уничтожает все судна, попадающиеся ему на пути. Все, но не Хаято. Герой уверен, что здесь что-то не так. Поэтому он отправляется в опасное путешествие, чтобы раскрыть тайну Корабля и остановить захватчика.

На археологических раскопках в Месопотамии происходит взрыв, после которого планета терпит сильные изменения. Небо становится похожим на зеркало, вся техника выходит из строя, а дети начинают рождаться с мистическими способностями.

Пересказ на новый лад эпоса древних шумеров о царе Гильгамеше. Из многих крупиц складывается мозаика, которая рассказывает о противостоянии великих сил.

Неожиданно в самых больших городах мира одновременно рушатся все небоскрёбы. Жестокая атака террористов повергает всех в панику. Доктор Гилмор, создатель девяти киборгов, которые в прошлом спасли мир от гибели, решает снова собрать старую команду и сразиться со злоумышленниками.