У молодого Юдзи Кайдо врачи обнаруживают неизвестную и пока неизлечимую болезнь. Чтобы иметь шанс выздороветь, он соглашается на криогенную заморозку, в надежде, что в будущем ему смогут помочь. Очнувшись через 20 лишним лет, Юдзи обнаруживает, что Землю атаковали инопланетяне и по всей планете прошли ожесточённые бои. Выясняется, что именно тот, в прошлом неизлечимый вирус, носителем которого является наш герой — самое действенное оружие против агрессивных инопланетных захватчиков.

В третьем фильме рассказывается о Теншинхане и Чаоцу в битве против Тао-пай-пая. Здесь Чаоцу — принц, Теншинхан — его телохранитель. И вот, повелителю Журавлей и Тао-Пай-паю вздумалось захватить власть в королевстве.

Мюнхен, 1923 год. Два года прошло с тех пор, как Эдварда Элрика забросило в наш мир из его собственного мира, где остался его родной край, друзья и младший брат, Альфонс. Лишившись возможности применять алхимию, Эд всё это время занимался исследованиями в области ракетной техники вместе с Альфонсом Хайдерихом — молодым человеком, очень похожим на его младшего брата, — надеясь, что таким образом отыщет способ вернуться домой. До сих пор его труды оказывались тщетны, но когда он узнал, что Общество Туле — оккультистская группа, близко связанная с нацистской партией, — обнаружила ключ к местонахождению легендарной, мистической страны Шамбалы, надежды Эдварда вспыхнули с новой силой. Тем временем в своём родном мире Альфонс Элрик все глубже погружается в тайны алхимии, ища способ воссоединиться со своим старшим братом.

Три века назад Лес пробудился, и Луна низвергла на Землю зловещего Зверя. Род людской обратился в ужас… Ныне мир совсем не похож на то, чем он был до катастрофы. Остатки человечества малочисленны и разобщены: часть пытается сосуществовать с Лесом, другая часть ищет способы покорить то, чего не способна понять. Агито, сын героя, ставит под угрозу уничтожения всех людей, пробудив от векового сна юную Тулу. Увидев, во что превратилась Земля, Тула призывает древнюю технологию, чтобы выстроить новое будущее на останках прежнего мира. Заручившись благословением Леса, Агито должен спасти девушку от самой себя — ведь только так можно уберечь человеческую расу от окончательной гибели.

После смерти матери Тоора Хонда оказывается в семье Соума, состоящей из трёх братьев: Юки, «прекрасного птица» из их школы, Кия, горячего и вспыльчивого изгоя, и озорного Шигуре. Тоора узнаёт тайну семьи Соума, что когда любой из членов этой семьи обнимает противоположный пол он превращаются в одного из 12 животных китайского зодиака. Наполненная множеством милых персонажей и сюжетных поворотов, жизнь в доме Соумы никогда не будет прежней.