250 лет тому назад. Соэцу, мелкий ростовщик, убит жестоким самураем Синдзаэмоном, и его тело было сброшено в Касанэ-га-фути — омут извилистой реки, где, согласно легенде, тот, кто упадет в воду, никогда снова не всплывет на поверхность. 20 лет спустя Синкити, красавец-сын Синдзаемона, случайно знакомится с Тоёсигой, дочерью Соэцу, и они влюбляются друг в друга. Когда Тоёсига умирает от странной болезни, Синкити обнаруживает, что он не только не может избежать таинственных несчастий прошлого и неумирающей любви к нему Тоёсиги, но и вынужден посмотреть в лицо страшной правде, которую хранит Касанэ-га-фути.

Тошихико Хорибэ живёт в квартире один, имеет посредственную работу, а также подрабатывает в магазине. Он буквально одержим моделью, которую каждый день видит на одном из плакатов на стене на своём рабочем месте. Аи Асака — та самая модель. Пока она не так известна, как хотела бы, и вместе со своим менеджером девушка планирует своё восхождение на вершину славы, начиная карьеру певицы. Однажды Аи оказывается поблизости и заходит в магазин. Там она встречает Хорибэ, который никак не может поверить в своё счастье, что его мечта стоит прямо перед ним. Одержимость парня выходит за границы его разума, и он начинает видоизменяться.

Для того чтобы увидеть Старую Столицу, Ядзи-сан и Кита-сан должны были пройти ни много ни мало 496 километров.

В фильме «Мёд и клевер» отражена жизнь студентов художественного колледжа: экзамены и дипломные работы, творчество и самовыражение, любовь и поиск своего «я». Главные герои меняются со временем, взрослеют и продолжают познавать мир. Фильм не ограничен учебой — история наполнена воспоминаниями о прошлом, отношениями с друзьями и коллегами, разнообразными событиями повседневности.