Анимационный фильм рассказывает о приключениях группы друзей, которые смогли из микроволновки сделать устройство позволяющее отправлять в прошлое сообщения. Герои начинают проводить различные эксперименты, чтобы усовершенствовать своё изобретение, но неожиданно попадают под наблюдение секретной организации «SERN», которая работает над такой же задачей.

2027-ой год. Прошёл ровно год после того, как закончилась неатомная Четвёртая мировая война. Мир нарушает взрыв бомбы. Происшествие начинает расследовать Мотоко Кусанаги.

2027-ой год. Во время взрыва бомбы в Ньюпорт-Сити погибает торговец оружием, связанный с организацией 501. Сотрудник службы безопасности обращается за помощью к Мотоко Кусанаги, чтобы разобраться в этом деле. Тогуса же считает, что Кусанаги сама является преступником, а его расследование убийств проституток связано с этим взрывом.

В старшей школе Харатцуки прошёл набор участников в клуб по игре в настольный теннис. Два друга Макото Цукимото и Ютака Хошино — новички в команде, но они оба настолько хорошо играют, что вполне могут превзойти своего капитана. Однажды к ним в школу переводится школьник по обмену из Китая, который смог обыграть Ютаку всухую. Встретив, наконец, серьёзного противника, герой начинает упорные тренировки, чтобы превзойти дерзкого новичка.