Шерлок Холмс — сыщик из Великобритании, отправленный в Нью-Йорк для лечения в реабилитационном центре. После завершения лечения герой решает осесть в Бруклине, консультируя местную полицию. Помощь в расследованиях ему оказывает доктор Джоан Ватсон, нанятая отцом Шерлока для наблюдения.

Сериал представляет собой сборник мистических новелл, действие которых происходит в фэнтези-мире. Сюжеты эпизодов частично повторяют отдельные серии одноимённого сериала 1959-го года. Каждая история — это экранизация мрачного атмосферного рассказа с отдельными персонажами, которых в финале непременно ждёт печальная участь. В сериале можно встретить самые разнообразные смысловые линии: напряжённые преследования героев, научная фантастика, ужасы и хоррор.

В 9784 году по летоисчеслению Содружества, ницшеанцы подняли восстание против Содружества Систем, стремясь избавиться от контроля и установить собственный порядок. Началась война, исход которой должен был изменить весь мир. Дабы не допустить победы врага, на встречу их флоту был направлен крейсер Звёздной Гвардии Содружества «Созвездие Андромеды» под командованием капитана Дилана Ханта.Однако, самое мощное судно из когда-либо созданных людьми, попало в западню ницшеанского флота. Не видя никаких возможностей спастись, капитан отдал приказ экипажу эвакуироваться с корабля. Сама же «Андромеды» вместе с капитаном Хантом стала пленником временной аномалии на границе чёрной дыры в системе Гефеста. Вскоре Содружество Систем было повержено, однако, Ницшеанская Империя так и не была создана. С этого времени вселенная погрузилась во тьму и хаос «Долгой Ночи».Прошло 303 года, прежде чем корабль «Эврика Мару», находящийся под командованием Беки Валентайн, смог вытащить когда-то могущественное судно Содружества с орбиты чёрной дыры. Для всех жителей вселенной прошло 303 года, тогда как для Дилана Ханта прошло лишь одно мгновение. Объединившись с членами экипажа «Эврики Мару», капитан Хант взялся за миссию по восстановлении Содружества Систем, прекрасно зная, что этот путь к его цели будет долгим и сложным.

Мировое сообщество шокировано одновременным появлением 4400 человек, некогда пропавших без вести. Каждый из них отсутствовал от нескольких месяцев до нескольких десятилетий, но ни капли не постарел и оказался лишён воспоминаний о своём потустороннем опыте. Федеральные агенты обеспокоены ситуацией, поэтому в срочном порядке начинают изучение новых сверхспособностей вернувшихся.