Спустя 31 год после Третьей мировой войны и ядерной бомбардировки столицы Японии, воссоздан новый город — Нью Токио.Внешне все под контролем, однако, организация страны теперь напоминает профашистское государство, жесточайшим образом подавляющая попытки мятежа. В исследовательских центрах проводятся парапсихологические опыты над людьми для разработки совершенного вида оружия.Военные, в лице полковника Сикисима, руководителя проекта биологических военных экспериментов, входят в конфликт с политическим крылом правительства. А в стране возникает религиозный культ сверхчеловека по имени Акира, приход которого, якобы, может решить все проблемы Японии.

Проводив бабушку в длительную поездку в Нагасаки, Мимико осталась совсем одна — родителей у нее не было. Каково же было ее удивление, когда вернувшись домой с вокзала, Мимико обнаружила у себя дома двух панд — отца и сына. Девочка очень обрадовалась неожиданным гостям. Узнав, что у Мими нет родителей, папа-панда решает заменить девочке отца, мотивируя это тем, что он и так уже отец и знает как это делается.

Семилетняя Мимико остаётся дома одна. Так как она живёт в маленькой деревушке, где обитают добрые жители, героиня не боится проводить это время в одиночестве. Возвращаясь домой после прогулки, Мимико обнаруживает у себя дома необычного гостя – панду. Вскоре появляется ещё одна панда, отец маленького животного. Вместе они становятся дружной семьёй на то время, пока девочка живёт без взрослых.