Каждому городу нужны герои. Шредер и его приспешники Клан Футов держат жителей Нью-Йорка в страхе и контролируют всех - от полиции до политиков. Будущее кажется удручающим пока на защиту города не встают четыре брата, поднявшиеся на нью-йоркские улицы из канализации. Теперь их судьба - быть Черепашками-ниндзя. Они вынуждены работать с бесстрашной журналисткой Эйприл и её мудрым оператором Верном Фенвиком, чтобы спасти город разгадать дьявольский план Шредера.

Когда-то давным-давно Зевс, Аида и Посейдон свергли своего отца - титана Кроноса - и отправили его в Тартар. По прошествии веков, когда значимость Богов в глазах людей начинает падать, Аид с Аресом решают объединиться с Кроносом, чтобы свергнуть Зевса. Тем временем отважный герой полубог Персей живёт спокойной жизнью на берегу океана и воспитывает 10-летнего сына. Однако он не может игнорировать своё истинное призвание, и вместе с Андромедой, полубогом Агенором и Гефестом спускается в подземный мир, чтобы помешать воцарению ада на земле.